Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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