Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm37830-201ENSMUST00000195282 837 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms