Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 AC133207.1-201ENSMUST00000218960 1431 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 AC164978.1-201ENSMUST00000228608 4011 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms