Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Olfr451-ps1-201ENSMUST00000205127 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm16260-201ENSMUST00000155141 304 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm15647-201ENSMUST00000160178 691 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
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