Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm22631-201ENSMUST00000179656 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Snord116l12-201ENSMUST00000179816 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm25471-201ENSMUST00000180126 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm28888-201ENSMUST00000186556 316 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm28190-201ENSMUST00000189766 722 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm28548-201ENSMUST00000191599 409 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm36961-201ENSMUST00000191980 132 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm7392-201ENSMUST00000217815 345 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 AC126939.4-201ENSMUST00000225360 743 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 AC154806.1-202ENSMUST00000227949 885 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 AC154649.2-201ENSMUST00000228189 808 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 4930556J24Rik-201ENSMUST00000042344 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm5815-201ENSMUST00000050706 1185 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 BC048671-201ENSMUST00000054799 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Olfr1013-201ENSMUST00000065626 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Olfr775-201ENSMUST00000097163 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm17130-201ENSMUST00000201542 2683 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Cfap44-201ENSMUST00000099742 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Slc4a8-201ENSMUST00000023776 11790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 E430024I08Rik-202ENSMUST00000220632 1513 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm15095-201ENSMUST00000118996 1430 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm38661-201ENSMUST00000216555 5814 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Hoxd9P28357 Gm42614-201ENSMUST00000198724 1554 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm16427-203ENSMUST00000201432 2042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm6787-201ENSMUST00000123120 1454 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Hoxd9P28357 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Hoxd9P28357 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Hoxd9P28357 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Eif4g2-213ENSMUST00000162415 7995 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Fto-202ENSMUST00000125471 3887 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Amd-ps4-201ENSMUST00000118392 1003 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm13680-201ENSMUST00000119790 793 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm9378-201ENSMUST00000120315 471 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Dmrtc1a-203ENSMUST00000120808 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm10680-201ENSMUST00000156612 702 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Nrbf2-202ENSMUST00000159002 583 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm6838-201ENSMUST00000172851 582 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms