Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Gm5835-201ENSMUST00000185806 1270 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 1700016D06Rik-202ENSMUST00000190741 604 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm20690-202ENSMUST00000195126 355 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm43287-201ENSMUST00000197747 600 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm43560-201ENSMUST00000198100 773 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Olfr316-201ENSMUST00000203731 1011 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Lnp1-201ENSMUST00000210579 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Olfr908-201ENSMUST00000215139 932 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm40853-201ENSMUST00000221342 582 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 AC158535.1-201ENSMUST00000221487 769 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 AC164424.1-201ENSMUST00000221690 170 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm35558-202ENSMUST00000221819 499 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm9255-201ENSMUST00000223225 581 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 AC119573.1-201ENSMUST00000227960 757 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Olfr609-201ENSMUST00000055787 965 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Tas2r118-201ENSMUST00000062463 900 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Nat2-202ENSMUST00000163856 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Sox6-202ENSMUST00000106612 8193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Usp15-201ENSMUST00000020334 4666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Sec16b-202ENSMUST00000086130 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Pard3bos1-202ENSMUST00000138535 1878 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Thrb-201ENSMUST00000022303 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Pecam1-203ENSMUST00000103069 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Pet2-201ENSMUST00000113959 4183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Pet2-202ENSMUST00000113960 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Musk-203ENSMUST00000098057 3422 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm11934-201ENSMUST00000132553 1536 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm7972-203ENSMUST00000209180 2184 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Acsm5-201ENSMUST00000066465 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Zhx3-201ENSMUST00000103111 9563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Kantr-207ENSMUST00000195280 4212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Krt39-202ENSMUST00000107445 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm26888-201ENSMUST00000181119 3683 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Zfp37-201ENSMUST00000068822 3494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm37326-201ENSMUST00000192828 3071 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Adgrg7-201ENSMUST00000023437 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Rtel1-202ENSMUST00000054622 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 AC158605.4-201ENSMUST00000219013 3361 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Mir3085-201ENSMUST00000175493 89 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm28006-201ENSMUST00000183841 122 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Mocs2-212ENSMUST00000184214 551 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 1700074A21Rik-201ENSMUST00000192404 346 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Cd69-203ENSMUST00000204411 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Olfr1422-ps1-201ENSMUST00000208076 743 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxb2P0C1T1 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms