Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
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