Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Tirap-201ENSMUST00000175765 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r193-203ENSMUST00000227562 6840 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm26512-201ENSMUST00000181874 3042 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 4931406P16Rik-201ENSMUST00000085592 5798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Nup155-201ENSMUST00000163765 6402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 4930444A19Rik-201ENSMUST00000188243 2117 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Rbm12-201ENSMUST00000059647 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Efl1-201ENSMUST00000039881 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Mettl14-202ENSMUST00000090371 7197 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Rbms3-202ENSMUST00000068962 3320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Ripor2-204ENSMUST00000110383 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Pcdh15-216ENSMUST00000131724 6322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Col5a3Q9JLI2 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Col5a3Q9JLI2 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Col5a3Q9JLI2 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Mycbp2-201ENSMUST00000159855 15233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm37233-201ENSMUST00000192173 6263 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Ctnnd1-221ENSMUST00000111695 6344 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Dclk1-207ENSMUST00000198412 4282 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Etv5-203ENSMUST00000168774 3773 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Setd7-201ENSMUST00000037141 7411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Olfr157-201ENSMUST00000214281 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm28157-201ENSMUST00000187675 2165 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm29146-201ENSMUST00000188904 2165 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm28772-201ENSMUST00000189554 2165 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm37547-201ENSMUST00000193277 2165 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Ncbp3-201ENSMUST00000021135 12106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Saal1-201ENSMUST00000143082 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.9 ms