Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Myh15-201ENSMUST00000168680 6340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Mtif2-201ENSMUST00000020749 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rb1cc1Q9ESK9 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rb1cc1Q9ESK9 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Slc43a2-201ENSMUST00000042561 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rb1cc1Q9ESK9 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Cebpz-201ENSMUST00000024885 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Phf3-205ENSMUST00000186733 7567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Efl1-205ENSMUST00000179489 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rb1cc1Q9ESK9 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rb1cc1Q9ESK9 6530403H02Rik-202ENSMUST00000182124 3191 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Rb1cc1Q9ESK9 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Nrp2-206ENSMUST00000114157 6357 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Vps8-206ENSMUST00000118923 4838 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r26-203ENSMUST00000228070 4419 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms