Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28751-201ENSMUST00000189287 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm29559-201ENSMUST00000189412 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28272-201ENSMUST00000189512 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28483-201ENSMUST00000189519 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28123-201ENSMUST00000189725 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28368-201ENSMUST00000189804 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm29119-201ENSMUST00000189973 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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Ctnna3Q65CL1 Gm29239-201ENSMUST00000190304 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28837-201ENSMUST00000190397 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28968-201ENSMUST00000190413 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28531-201ENSMUST00000190529 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28165-201ENSMUST00000190669 694 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm38229-201ENSMUST00000191931 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm32347-201ENSMUST00000192944 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm38121-201ENSMUST00000193213 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm38035-201ENSMUST00000194427 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm38350-201ENSMUST00000194789 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm37990-201ENSMUST00000195821 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Ctnna3Q65CL1 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Ctnna3Q65CL1 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Ctnna3Q65CL1 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Ctnna3Q65CL1 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Ctnna3Q65CL1 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Ctnna3Q65CL1 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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