Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm12459-201ENSMUST00000120659 356 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 7330423F06Rik-201ENSMUST00000197499 301 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Mif-ps7-201ENSMUST00000223357 327 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 AC129208.1-201ENSMUST00000227474 2906 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Gm28047Q3US59 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm14241-201ENSMUST00000151260 264 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm24190-201ENSMUST00000157976 216 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm17047-201ENSMUST00000167709 430 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm27019-201ENSMUST00000183056 404 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm28894-201ENSMUST00000185214 615 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm37369-201ENSMUST00000194179 615 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 AC113305.1-201ENSMUST00000214664 724 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm32443-201ENSMUST00000217880 707 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms