Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Hsd17b13-201ENSMUST00000048118 1708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sox12Q04890 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sox12Q04890 Cd200-202ENSMUST00000163230 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sox12Q04890 Prpf18-201ENSMUST00000035721 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 9930024M15Rik-201ENSMUST00000214902 2584 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 F630040K05Rik-201ENSMUST00000180519 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sox12Q04890 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Prickle2-201ENSMUST00000032093 7754 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sox12Q04890 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Meis1-201ENSMUST00000068264 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Ppfia1-202ENSMUST00000182226 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Snrpd3-201ENSMUST00000020397 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Nolc1-209ENSMUST00000225780 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Pln-202ENSMUST00000163319 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Hnrnpk-221ENSMUST00000177497 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox12Q04890 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sox12Q04890 AC153526.3-201ENSMUST00000220145 2183 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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