Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm12931-201ENSMUST00000117046 324 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm17937-201ENSMUST00000197908 742 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Olfr928-ps1-201ENSMUST00000213313 237 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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Hoxd13P70217 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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Hoxd13P70217 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms