Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm31711-201ENSMUST00000220687 196 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm7437-201ENSMUST00000156744 661 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm27160-201ENSMUST00000184837 199 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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