Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm13532-201ENSMUST00000120373 240 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm18705-201ENSMUST00000215985 913 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp4P35123 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp4P35123 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp4P35123 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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