Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm37356-201ENSMUST00000193362 1613 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Usp54-201ENSMUST00000022356 6580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Hmgn2-202ENSMUST00000102552 676 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Lair1-204ENSMUST00000108600 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm11965-201ENSMUST00000122017 277 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm2855-201ENSMUST00000166765 456 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm17235-201ENSMUST00000169128 964 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm3002-202ENSMUST00000178256 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm3252-202ENSMUST00000178748 450 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm2974-202ENSMUST00000180184 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm9451-201ENSMUST00000188491 604 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 1700017N19Rik-204ENSMUST00000188736 1709 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm19148-201ENSMUST00000197045 429 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm44036-201ENSMUST00000204551 336 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm44448-201ENSMUST00000205104 393 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Slc25a5-ps-203ENSMUST00000223928 1442 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm9801-201ENSMUST00000054860 408 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 A330008L17Rik-201ENSMUST00000064349 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Krtap8-1-201ENSMUST00000072280 579 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm8836-201ENSMUST00000198196 1348 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Abcc9-202ENSMUST00000087527 6213 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Synj2bp-204ENSMUST00000164431 3305 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm37151-201ENSMUST00000194631 5007 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Chn1os3-201ENSMUST00000147420 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm13252-201ENSMUST00000119355 321 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm14939-201ENSMUST00000120347 680 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm15989-201ENSMUST00000121895 498 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Olfr325-201ENSMUST00000169428 1065 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm26505-201ENSMUST00000176208 166 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Trav5d-4-201ENSMUST00000179701 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Trav5n-4-201ENSMUST00000179997 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm8304-201ENSMUST00000185744 584 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm28980-201ENSMUST00000187877 219 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm18864-201ENSMUST00000194518 1051 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm7879-202ENSMUST00000200338 635 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm30771-201ENSMUST00000205683 737 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms