Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 AC154461.6-201ENSMUST00000224815 2630 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Kcna2-203ENSMUST00000197470 4370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm28718-201ENSMUST00000188417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm28977-201ENSMUST00000188678 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Slfn5-201ENSMUST00000067443 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Casr-203ENSMUST00000172826 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 C8a-203ENSMUST00000106808 3539 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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