Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Depdc5-205ENSMUST00000120902 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Cfap44-201ENSMUST00000099742 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Akap2-204ENSMUST00000102902 6993 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Trpm3-206ENSMUST00000099569 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Akap2-206ENSMUST00000107598 6830 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Olfr551-202ENSMUST00000213540 5440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm11680-201ENSMUST00000146550 439 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Slc41a2-201ENSMUST00000039956 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Map3k13-201ENSMUST00000042065 6709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Dnajc6-201ENSMUST00000038207 5258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Wdr72-205ENSMUST00000215440 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprbB2RU80 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms