Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Grik3B1AS29 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms