Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Kat6b-209ENSMUST00000182964 7699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Ahcyl2-203ENSMUST00000115238 5129 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm232-201ENSMUST00000216549 2559 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm44898-201ENSMUST00000205934 2223 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Snrnp200-201ENSMUST00000103220 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Tenm4-202ENSMUST00000107165 10930 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Prpf18-201ENSMUST00000035721 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Fnbp1-201ENSMUST00000073879 8469 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Mroh2a-202ENSMUST00000113130 7491 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm14540-201ENSMUST00000138298 3261 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Pkd1-201ENSMUST00000035565 14164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
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Col5a3Q9JLI2 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Col5a3Q9JLI2 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Col5a3Q9JLI2 Kdm4c-201ENSMUST00000030102 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Qrich2-204ENSMUST00000208602 7260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r181-202ENSMUST00000226843 4496 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Myh10-201ENSMUST00000018887 7667 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Col5a3Q9JLI2 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 4930442L01Rik-201ENSMUST00000145865 2077 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Tex14-201ENSMUST00000060835 4763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Col5a3Q9JLI2 Efcab6-207ENSMUST00000156187 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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