Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc47Q9D024 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.1 ms