Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Map3k20-204ENSMUST00000135469 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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PtprtQ99M80 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Olfr1502-201ENSMUST00000074221 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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PtprtQ99M80 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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PtprtQ99M80 Mov10l1-201ENSMUST00000015509 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Edar-201ENSMUST00000003312 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm6878-201ENSMUST00000100448 2018 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Adamtsl1-203ENSMUST00000107178 7839 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Ttc28-201ENSMUST00000040111 10780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Olfr524-202ENSMUST00000215815 5044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm37633-201ENSMUST00000192858 2700 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Atxn7l1-208ENSMUST00000136644 3155 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
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PtprtQ99M80 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
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PtprtQ99M80 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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PtprtQ99M80 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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PtprtQ99M80 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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PtprtQ99M80 Olfr523-206ENSMUST00000216023 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
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PtprtQ99M80 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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PtprtQ99M80 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Map2-204ENSMUST00000114013 6258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Olfr686-204ENSMUST00000216613 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
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PtprtQ99M80 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
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