Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 Olfr928-ps1-201ENSMUST00000213313 237 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 Prkg1-201ENSMUST00000065067 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 Prdm11-202ENSMUST00000111274 11678 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Trappc12Q8K2L8 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
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Trappc12Q8K2L8 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Trappc12Q8K2L8 Ctnnd1-201ENSMUST00000036811 5126 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Trappc12Q8K2L8 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Trappc12Q8K2L8 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 Glce-203ENSMUST00000185675 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Trappc12Q8K2L8 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Trappc12Q8K2L8 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Trappc12Q8K2L8 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Trappc12Q8K2L8 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trappc12Q8K2L8 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Trappc12Q8K2L8 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trappc12Q8K2L8 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trappc12Q8K2L8 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Trappc12Q8K2L8 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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Trappc12Q8K2L8 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trappc12Q8K2L8 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trappc12Q8K2L8 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Trappc12Q8K2L8 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trappc12Q8K2L8 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trappc12Q8K2L8 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Trappc12Q8K2L8 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trappc12Q8K2L8 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trappc12Q8K2L8 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Trappc12Q8K2L8 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trappc12Q8K2L8 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trappc12Q8K2L8 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trappc12Q8K2L8 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Trappc12Q8K2L8 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Trappc12Q8K2L8 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.6 ms