Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm26512-201ENSMUST00000181874 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Sptan1-203ENSMUST00000100225 7892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Sptan1-202ENSMUST00000095083 7883 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm45017-201ENSMUST00000206842 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Svs1-201ENSMUST00000037696 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Ccdc14-201ENSMUST00000023532 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Cd163-202ENSMUST00000112541 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Ctnnd1-203ENSMUST00000067232 6119 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Smg7-201ENSMUST00000043560 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Hecw2-201ENSMUST00000087659 11171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Agtpbp1-206ENSMUST00000164215 4331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Acsl4-202ENSMUST00000112903 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Acsl4-203ENSMUST00000112904 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Wdr11-201ENSMUST00000084519 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Rttn-201ENSMUST00000023828 7268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm14783-201ENSMUST00000118900 663 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Zfp783-203ENSMUST00000130463 537 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 AC110381.1-201ENSMUST00000218987 586 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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