Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Abcc1-201ENSMUST00000100167 6792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Olfr1272-202ENSMUST00000117141 2442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Vezt-201ENSMUST00000047711 4479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 A130010J15Rik-203ENSMUST00000160822 3793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Dusp3-206ENSMUST00000151678 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm17137-201ENSMUST00000164106 4371 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gabrb3-202ENSMUST00000085240 5712 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm26455-201ENSMUST00000175300 92 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Ryr2-202ENSMUST00000170156 16813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Ryr2-201ENSMUST00000021750 16814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg9aQ68FE2 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.6 ms