Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

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Length 1,482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Golgb1-202ENSMUST00000039855 10847 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Slc12a1-201ENSMUST00000028630 4645 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Slc12a6-202ENSMUST00000053666 6060 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Gm37022-201ENSMUST00000192517 2254 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Setd5-202ENSMUST00000113155 6362 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Cd163-202ENSMUST00000112541 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
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Grin2bQ01097 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Gm43618-201ENSMUST00000197392 3451 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Grin2bQ01097 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Grin2bQ01097 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Grin2bQ01097 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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Grin2bQ01097 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Grin2bQ01097 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Gm37633-201ENSMUST00000192858 2700 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Dusp3-202ENSMUST00000107172 4445 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Sipa1l1-201ENSMUST00000053969 7488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Kdm4c-201ENSMUST00000030102 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Lca5-201ENSMUST00000034791 4160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Grin2bQ01097 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms