Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm38574-201ENSMUST00000211855 640 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Hoxd13P70217 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 D030045P18Rik-203ENSMUST00000214947 1938 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Hoxd13P70217 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Hoxd13P70217 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Hoxd13P70217 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Hoxd13P70217 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Hoxd13P70217 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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Hoxd13P70217 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms