Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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Cldn18P56857 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Hspe1-ps1-201ENSMUST00000222955 330 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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