Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms