Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 EU599041-203ENSMUST00000205748 1492 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 1700017N19Rik-210ENSMUST00000218464 1597 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Mtm1-206ENSMUST00000114621 3257 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Xlr5b-202ENSMUST00000114518 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Xlr5a-204ENSMUST00000179600 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Xlr5a-201ENSMUST00000078574 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Fto-202ENSMUST00000125471 3887 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Smc1b-201ENSMUST00000023068 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm13262-201ENSMUST00000149014 2022 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r40-201ENSMUST00000171942 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Vps29-202ENSMUST00000117868 720 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Rpl9-ps2-201ENSMUST00000120821 577 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm6689-201ENSMUST00000130905 481 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm22847-201ENSMUST00000157707 105 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm25372-201ENSMUST00000158161 255 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm8925-201ENSMUST00000197212 763 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm43287-201ENSMUST00000197747 600 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm19617-201ENSMUST00000202977 308 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr51-201ENSMUST00000076514 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Mir146b-201ENSMUST00000093619 109 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm34184-201ENSMUST00000216477 2713 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm37483-201ENSMUST00000194382 1484 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm37968-201ENSMUST00000195131 3201 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 AC132336.1-201ENSMUST00000222844 1740 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Fmo4-202ENSMUST00000111525 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Nipsnap3a-202ENSMUST00000107666 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Lair1-204ENSMUST00000108600 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm12098-201ENSMUST00000118277 508 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm13921-201ENSMUST00000119411 463 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm12687-201ENSMUST00000119752 706 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm11955-201ENSMUST00000119801 470 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm13586-201ENSMUST00000121784 464 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
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