Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Gm8865-201ENSMUST00000125697 430 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Trim39Q9ESN2 Esp24-201ENSMUST00000180245 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Trim39Q9ESN2 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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Trim39Q9ESN2 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Gm16273-201ENSMUST00000202238 268 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Olfr723-202ENSMUST00000206058 1078 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Trim39Q9ESN2 CT009550.3-201ENSMUST00000228542 455 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Apoc2-201ENSMUST00000003074 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Trim39Q9ESN2 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Trim39Q9ESN2 Olfr1162-201ENSMUST00000099837 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Trim39Q9ESN2 Hdhd2-209ENSMUST00000150990 3126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Gm37936-201ENSMUST00000194647 1322 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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Trim39Q9ESN2 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Cyp2d12-201ENSMUST00000068861 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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Trim39Q9ESN2 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Tmem147-206ENSMUST00000208169 537 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Gm5668-201ENSMUST00000220897 436 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Gm33682-201ENSMUST00000222233 256 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 CT009515.2-201ENSMUST00000226126 736 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 AC147096.1-201ENSMUST00000227648 352 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Llcfc1-201ENSMUST00000031900 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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