Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc51-203ENSMUST00000106963 835 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc51-204ENSMUST00000106964 872 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm15401-201ENSMUST00000081929 1107 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm11681-201ENSMUST00000127337 870 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm23222-201ENSMUST00000158117 76 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm20690-202ENSMUST00000195126 355 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms