Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 A430110L20Rik-202ENSMUST00000181680 2513 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Zfp207-203ENSMUST00000108216 2152 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Atg4dQ8BGV9 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Olfr1396-202ENSMUST00000109201 1170 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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Atg4dQ8BGV9 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Atg4dQ8BGV9 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Atg4dQ8BGV9 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Atg4dQ8BGV9 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 4930444A19Rik-201ENSMUST00000188243 2117 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Atg4dQ8BGV9 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Atg4dQ8BGV9 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Atg4dQ8BGV9 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Serpinb1a-201ENSMUST00000076352 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Atg4dQ8BGV9 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Nyap2-205ENSMUST00000137862 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Srcap-214ENSMUST00000190390 9633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Gm42490-201ENSMUST00000198595 2064 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Trpc4-201ENSMUST00000029311 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg4dQ8BGV9 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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