Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Akap2-205ENSMUST00000102903 6650 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Luzp4-201ENSMUST00000101185 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Ccdc141-207ENSMUST00000164114 6222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Alms1-205ENSMUST00000213058 11163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 A930030B08Rik-201ENSMUST00000207625 3965 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Hcfc1-201ENSMUST00000033761 8138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Klhl32-203ENSMUST00000108214 5970 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Ctnnd1-213ENSMUST00000111687 6030 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Pan2-203ENSMUST00000218315 4379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Rbm12-201ENSMUST00000059647 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Olfr157-201ENSMUST00000214281 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Hnrnpa3-203ENSMUST00000111962 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Zhx3-201ENSMUST00000103111 9563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm14085-201ENSMUST00000110521 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm13083-201ENSMUST00000105773 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Fndc3b-204ENSMUST00000195008 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Ccdc47-201ENSMUST00000002043 5193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 4930442L01Rik-201ENSMUST00000145865 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Ddx6-203ENSMUST00000217034 6029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Fto-203ENSMUST00000128081 4707 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NischQ80TM9 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NischQ80TM9 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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