Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r44-213ENSMUST00000228700 2004 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Grik2-204ENSMUST00000218441 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Morc2a-202ENSMUST00000096441 4594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm12392-201ENSMUST00000118014 938 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm13359-201ENSMUST00000119000 695 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Rps8-ps3-201ENSMUST00000121011 650 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Pla2g2a-203ENSMUST00000135748 788 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm7897-201ENSMUST00000193981 554 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Rab5a-ps-201ENSMUST00000203252 653 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm31663-202ENSMUST00000208481 1190 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm3912-203ENSMUST00000211024 367 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Olfr950-ps1-201ENSMUST00000213804 878 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 AL772265.1-201ENSMUST00000214379 305 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Ldah-206ENSMUST00000218086 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Icos-202ENSMUST00000102827 3241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Trpc4-201ENSMUST00000029311 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 A330058E17Rik-201ENSMUST00000200757 3890 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Arfgef1-203ENSMUST00000131556 3424 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Naalad2-201ENSMUST00000001826 2831 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm13607-201ENSMUST00000117875 539 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm23229-201ENSMUST00000157297 105 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm16580-201ENSMUST00000162696 1044 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm23145-201ENSMUST00000178912 79 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm21894-201ENSMUST00000179631 546 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms