Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 AC129208.1-201ENSMUST00000227474 2906 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Prpf4b-201ENSMUST00000077853 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Abcc1-201ENSMUST00000100167 6792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Adcy10-201ENSMUST00000027852 5210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Epha4-201ENSMUST00000027451 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnmb2-203ENSMUST00000178668 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37304-201ENSMUST00000193833 2886 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
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