Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 1700109I08Rik-201ENSMUST00000185680 396 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Gm29513-201ENSMUST00000185741 202 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Gm44134-201ENSMUST00000203064 661 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Fpr-rs7-201ENSMUST00000095637 1017 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Panct2-201ENSMUST00000181489 3849 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Arhgap12-208ENSMUST00000182213 4162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Mov10l1-201ENSMUST00000015509 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Spire1Q52KF3 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Gm27186-201ENSMUST00000184223 307 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Gm38333-201ENSMUST00000193608 604 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 AL929265.1-201ENSMUST00000213427 125 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Olfr768-201ENSMUST00000063031 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Spire1Q52KF3 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms