Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 March1-204ENSMUST00000110253 2748 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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