Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Ldah-206ENSMUST00000218086 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm17137-201ENSMUST00000164106 4371 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 A630009H07Rik-201ENSMUST00000208485 2159 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pkp1P97350 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144 ms