Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Deptor-201ENSMUST00000023056 3300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 AC159301.1-202ENSMUST00000225860 2133 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Ifit3b-201ENSMUST00000076249 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Olfr1320-203ENSMUST00000214375 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Prkaa1-202ENSMUST00000228218 4618 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Tssc1-206ENSMUST00000221877 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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