Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Adgrf4-204ENSMUST00000170723 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Slc22a26-201ENSMUST00000065634 2007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Strbp-202ENSMUST00000072186 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm4673-201ENSMUST00000181395 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Pik3r4-210ENSMUST00000191268 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Nos1-202ENSMUST00000102557 4591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Ctnnd1-210ENSMUST00000111684 6021 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gmfg-202ENSMUST00000108289 477 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm12642-201ENSMUST00000121098 876 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Prkag2os1-201ENSMUST00000134633 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm3513-201ENSMUST00000161319 637 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Mthfr-ps1-201ENSMUST00000174153 601 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm8296-201ENSMUST00000185597 524 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm42932-201ENSMUST00000197280 744 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Klrc1-202ENSMUST00000032271 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm6195-201ENSMUST00000063059 357 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm23678-201ENSMUST00000083157 107 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm23461-201ENSMUST00000083265 107 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 4933427D14Rik-202ENSMUST00000108506 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Vipas39-201ENSMUST00000021426 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Antxrl-201ENSMUST00000058725 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Wipf3-205ENSMUST00000163746 4102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm43623-201ENSMUST00000199289 2663 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Adamtsl1-203ENSMUST00000107178 7839 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm8204-201ENSMUST00000185696 2144 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Svep1-201ENSMUST00000042850 11629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Arpp21-203ENSMUST00000111872 3316 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Arpp21-229ENSMUST00000164754 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Rfx3-204ENSMUST00000172907 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 C87499-201ENSMUST00000053304 1901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm9776-201ENSMUST00000059598 2980 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Olfr338-203ENSMUST00000217511 5724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm38910-201ENSMUST00000204630 2448 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Rps20-203ENSMUST00000138502 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Cdh23-204ENSMUST00000105463 10991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Prdm16-202ENSMUST00000070313 8429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Pigr-201ENSMUST00000027675 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Synj2bp-204ENSMUST00000164431 3305 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Zfp68-202ENSMUST00000085852 3318 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Dock9-206ENSMUST00000212181 7368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm39323-201ENSMUST00000215913 2942 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Aoah-201ENSMUST00000021757 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Trpv1-202ENSMUST00000102526 3361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 B020014A21Rik-201ENSMUST00000217333 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Ces3a-202ENSMUST00000093223 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Pcdh15-228ENSMUST00000152819 2867 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Pdgfra-208ENSMUST00000202681 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gpm6b-203ENSMUST00000112224 4644 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm11649-201ENSMUST00000118214 375 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm13087-201ENSMUST00000118298 256 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm11558-201ENSMUST00000118454 459 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm16188-201ENSMUST00000142019 420 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Mir8099-2-201ENSMUST00000183568 127 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 1700039M15Rik-201ENSMUST00000195377 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm31881-202ENSMUST00000199455 559 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 D130017N08Rik-204ENSMUST00000199836 506 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Speer9-ps1-201ENSMUST00000203447 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms