Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Fer1l6-203ENSMUST00000161028 5714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Taf1-206ENSMUST00000149274 5954 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Ncor1-205ENSMUST00000101067 7243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Ceacam20-201ENSMUST00000094753 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Catsperg1-202ENSMUST00000069861 2251 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Impa1-201ENSMUST00000065938 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 5430420F09Rik-201ENSMUST00000194956 1799 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Olfr76-203ENSMUST00000214676 3175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm24462-201ENSMUST00000102430 106 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Ighv1-84-201ENSMUST00000103551 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm15606-202ENSMUST00000139851 711 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Svs3a-201ENSMUST00000017147 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm28483-201ENSMUST00000189519 696 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm32347-201ENSMUST00000192944 696 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Pkia-203ENSMUST00000193330 631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm2287-201ENSMUST00000197417 1084 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm42938-201ENSMUST00000198414 1072 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm5314-201ENSMUST00000204852 466 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 A930014E10Rik-201ENSMUST00000205115 546 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm44561-201ENSMUST00000208869 264 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm4052-201ENSMUST00000220890 451 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 AC162183.1-201ENSMUST00000224843 472 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 AC163038.4-201ENSMUST00000224942 474 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Olfr996-201ENSMUST00000077075 1068 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Krtap26-1-201ENSMUST00000095934 973 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Olfr1290-201ENSMUST00000099616 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 St7-206ENSMUST00000115417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Platr30-202ENSMUST00000199348 1934 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Bbs9-210ENSMUST00000147712 3495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Olfr433-202ENSMUST00000214690 2968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Zfp445-201ENSMUST00000056467 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Coq8a-217ENSMUST00000170472 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Itpr2-202ENSMUST00000079573 11679 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Rian-209ENSMUST00000182406 3476 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Ccdc127-203ENSMUST00000160021 2682 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm18908-201ENSMUST00000207125 1483 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 CT009515.4-201ENSMUST00000228165 1494 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Ncor1-204ENSMUST00000101066 8852 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Nsun2-201ENSMUST00000022087 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm42700-201ENSMUST00000199071 2437 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Olfr455-202ENSMUST00000217978 4054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Cpsf6-208ENSMUST00000177145 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Ugt3a2-201ENSMUST00000072403 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Trim66-203ENSMUST00000106741 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 AC122426.1-201ENSMUST00000214736 2235 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gdi2-209ENSMUST00000223396 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm25725-201ENSMUST00000104528 130 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 1700029I15Rik-202ENSMUST00000111280 416 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm13521-201ENSMUST00000118922 866 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Mrpl48-ps-201ENSMUST00000121413 636 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms