Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Frem3-201ENSMUST00000039695 6384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Ikbkg-201ENSMUST00000004330 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Olfr1384-202ENSMUST00000213776 4437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Cdon-201ENSMUST00000042842 7213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Col25a1-202ENSMUST00000106353 6701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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PtprbB2RU80 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Igsf1-201ENSMUST00000033442 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Atp2b4-203ENSMUST00000125659 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtprbB2RU80 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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