Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Serpina3a-203ENSMUST00000185595 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr1315-ps1-203ENSMUST00000217078 1559 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm26561-201ENSMUST00000180743 1413 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Skap1-201ENSMUST00000071510 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Zfp467-207ENSMUST00000114563 463 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm12814-201ENSMUST00000117091 846 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm14981-201ENSMUST00000117325 943 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm6798-201ENSMUST00000119961 360 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm14939-201ENSMUST00000120347 680 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Cyp4a30-ps-201ENSMUST00000120813 1020 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm11260-201ENSMUST00000121163 942 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm13466-201ENSMUST00000121515 999 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm40614-201ENSMUST00000125161 1254 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm14170-201ENSMUST00000133751 331 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Vmn2r-ps31-201ENSMUST00000176474 760 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm26612-201ENSMUST00000180785 1055 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm29041-201ENSMUST00000189199 380 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm29145-201ENSMUST00000189914 456 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm29517-201ENSMUST00000190744 351 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm29018-202ENSMUST00000191356 313 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm29999-202ENSMUST00000193554 671 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm38221-201ENSMUST00000195146 365 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Selenok-ps7-201ENSMUST00000197069 283 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm3604-203ENSMUST00000202194 736 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Fxyd4-208ENSMUST00000204950 586 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 4930557K07Rik-201ENSMUST00000205110 363 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 D830044I16Rik-203ENSMUST00000205437 1016 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 AC079644.1-201ENSMUST00000220586 405 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 4930448F12Rik-201ENSMUST00000220795 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 CT033781.3-201ENSMUST00000221886 504 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 AC134917.3-201ENSMUST00000222057 1283 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm2721-202ENSMUST00000222652 459 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 AC207128.2-202ENSMUST00000224010 808 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 AC122877.1-201ENSMUST00000228873 218 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Prap1-201ENSMUST00000026540 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr1494-201ENSMUST00000051768 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 1700028K03Rik-201ENSMUST00000058921 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Rpl21-ps5-201ENSMUST00000095940 483 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm17229-202ENSMUST00000166792 1753 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 2010110K18Rik-201ENSMUST00000181453 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Brdt-202ENSMUST00000112677 1607 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Glrx-204ENSMUST00000223120 1333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm2163-201ENSMUST00000179734 2723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 2310015D24Rik-202ENSMUST00000187920 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Lilra5-201ENSMUST00000117550 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Gm33533-201ENSMUST00000193853 1633 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Snord70-201ENSMUST00000104157 87 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Spata48-202ENSMUST00000109678 753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Gm12402-201ENSMUST00000120536 334 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Gm5883-201ENSMUST00000120735 495 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim39Q9ESN2 Gm12517-201ENSMUST00000122082 425 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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