Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm3103-201ENSMUST00000198073 752 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 AC146596.1-201ENSMUST00000223507 223 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Olfr204-201ENSMUST00000072517 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm6054-201ENSMUST00000078052 378 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Defa35-201ENSMUST00000078121 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm14621-201ENSMUST00000117709 689 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm20430-201ENSMUST00000172474 207 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 1700016L21Rik-202ENSMUST00000189139 629 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Platr25-208ENSMUST00000222602 939 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 1700123O20Rik-203ENSMUST00000227269 893 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc97Q9DBT3 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc97Q9DBT3 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc97Q9DBT3 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc97Q9DBT3 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc97Q9DBT3 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc97Q9DBT3 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc97Q9DBT3 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc97Q9DBT3 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms