Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Lingo2-202ENSMUST00000098151 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Olfr521-203ENSMUST00000220001 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm26455-201ENSMUST00000175300 92 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gga3Q8BMI3 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms