Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ChfrQ810L3 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108 ms