Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm28222-201ENSMUST00000191210 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm28776-201ENSMUST00000191282 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm29306-201ENSMUST00000191366 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm28136-210ENSMUST00000191432 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm29251-201ENSMUST00000191480 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm28658-201ENSMUST00000191532 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC6.52□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC6.52□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trafd1Q3UDK1 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.8 ms