Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Q3U6N9 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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Q3U6N9 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Q3U6N9 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Q3U6N9 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Q3U6N9 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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Q3U6N9 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Q3U6N9 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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