Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Agl-208ENSMUST00000162792 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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Hoxc13P50207 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Hoxc13P50207 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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Hoxc13P50207 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Hoxc13P50207 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Hoxc13P50207 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Hoxc13P50207 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Igsf1-201ENSMUST00000033442 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Adgrl3-211ENSMUST00000120128 6370 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Med12l-202ENSMUST00000040325 10159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Homer1-205ENSMUST00000109492 1533 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms